Description
This pretrained pipeline is built on the top of ner_clinical model.
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How to use
from sparknlp.pretrained import PretrainedPipeline
ner_pipeline = PretrainedPipeline("ner_clinical_pipeline", "pt", "clinical/models")
result = ner_pipeline.annotate("""Uma mulher de 50 anos veio à clínica ortopédica com queixas de dor persistente, inchaço e limitação da amplitude de movimentos no joelho direito. A doente referia uma história de osteoartrite e uma lesão anterior no joelho. Foi efectuado um exame clínico e radiografias que revelaram um estreitamento do espaço articular, formação de osteófitos e sinais de degeneração da cartilagem. Para confirmar o diagnóstico e avaliar a gravidade, foi pedida uma ressonância magnética. A RM mostrou uma perda extensa de cartilagem e alterações ósseas consistentes com osteoartrite avançada. Depois de considerar a condição e as preferências do doente, foi discutido um plano de tratamento que envolvia o controlo da dor, fisioterapia e a possibilidade de cirurgia de substituição da articulação.""")
import com.johnsnowlabs.nlp.pretrained.PretrainedPipeline
val ner_pipeline = PretrainedPipeline("ner_clinical_pipeline", "pt", "clinical/models")
val result = ner_pipeline.annotate("""Uma mulher de 50 anos veio à clínica ortopédica com queixas de dor persistente, inchaço e limitação da amplitude de movimentos no joelho direito. A doente referia uma história de osteoartrite e uma lesão anterior no joelho. Foi efectuado um exame clínico e radiografias que revelaram um estreitamento do espaço articular, formação de osteófitos e sinais de degeneração da cartilagem. Para confirmar o diagnóstico e avaliar a gravidade, foi pedida uma ressonância magnética. A RM mostrou uma perda extensa de cartilagem e alterações ósseas consistentes com osteoartrite avançada. Depois de considerar a condição e as preferências do doente, foi discutido um plano de tratamento que envolvia o controlo da dor, fisioterapia e a possibilidade de cirurgia de substituição da articulação.""")
Results
| | chunks | begin | end | entities |
|---:|:-------------------------------------------------------|--------:|------:|:-----------|
| 0 | dor persistente | 63 | 77 | PROBLEM |
| 1 | inchaço | 80 | 86 | PROBLEM |
| 2 | limitação da amplitude de movimentos no joelho direito | 90 | 143 | PROBLEM |
| 3 | osteoartrite | 179 | 190 | PROBLEM |
| 4 | uma lesão anterior no joelho | 194 | 221 | PROBLEM |
| 5 | exame clínico | 241 | 253 | TEST |
| 6 | radiografias | 257 | 268 | TEST |
| 7 | estreitamento do espaço articular | 287 | 319 | PROBLEM |
| 8 | osteófitos | 334 | 343 | PROBLEM |
| 9 | sinais de degeneração da cartilagem | 347 | 381 | PROBLEM |
| 10 | uma ressonância magnética | 447 | 471 | TEST |
| 11 | A RM | 474 | 477 | TEST |
| 12 | perda extensa de cartilagem | 491 | 517 | PROBLEM |
| 13 | alterações ósseas | 521 | 537 | PROBLEM |
| 14 | osteoartrite avançada | 556 | 576 | PROBLEM |
| 15 | dor | 704 | 706 | PROBLEM |
| 16 | fisioterapia | 709 | 720 | TREATMENT |
| 17 | cirurgia de substituição da articulação | 743 | 781 | TREATMENT |
Model Information
| Model Name: | ner_clinical_pipeline |
| Type: | pipeline |
| Compatibility: | Healthcare NLP 5.0.2+ |
| License: | Licensed |
| Edition: | Official |
| Language: | pt |
| Size: | 1.2 GB |
Included Models
- DocumentAssembler
- SentenceDetectorDLModel
- TokenizerModel
- WordEmbeddingsModel
- MedicalNerModel
- NerConverterInternalModel