Description
This pretrained pipeline is built on the top of ner_clinical model.
Live Demo Open in Colab Copy S3 URI
How to use
from sparknlp.pretrained import PretrainedPipeline
ner_pipeline = PretrainedPipeline("ner_clinical_pipeline", "tr", "clinical/models")
result = ner_pipeline.annotate("""50 yaşında bir kadın hasta ortopedi kliniğine sağ dizinde sürekli ağrı, şişlik ve hareket kısıtlılığı şikâyetleriyle başvurdu. Hasta osteoartrit ve daha önce geçirilmiş diz yaralanması öyküsü bildirdi. Klinik muayene ve çekilen röntgenlerde eklem aralığında daralma, osteofit oluşumu ve kıkırdak dejenerasyonu bulguları tespit edildi. Tanıyı doğrulamak ve ciddiyetini değerlendirmek için bir MR taraması istendi. MRG, ileri osteoartrit ile uyumlu yoğun kıkırdak kaybı ve kemik değişiklikleri gösterdi. Hastanın durumu ve tercihleri göz önünde bulundurulduktan sonra fizik tedavi ve eklem replasmanı ameliyatı olasılığını içeren bir tedavi planı tartışıldı.""")
import com.johnsnowlabs.nlp.pretrained.PretrainedPipeline
val ner_pipeline = PretrainedPipeline("ner_clinical_pipeline", "tr", "clinical/models")
val result = ner_pipeline.annotate("""50 yaşında bir kadın hasta ortopedi kliniğine sağ dizinde sürekli ağrı, şişlik ve hareket kısıtlılığı şikâyetleriyle başvurdu. Hasta osteoartrit ve daha önce geçirilmiş diz yaralanması öyküsü bildirdi. Klinik muayene ve çekilen röntgenlerde eklem aralığında daralma, osteofit oluşumu ve kıkırdak dejenerasyonu bulguları tespit edildi. Tanıyı doğrulamak ve ciddiyetini değerlendirmek için bir MR taraması istendi. MRG, ileri osteoartrit ile uyumlu yoğun kıkırdak kaybı ve kemik değişiklikleri gösterdi. Hastanın durumu ve tercihleri göz önünde bulundurulduktan sonra fizik tedavi ve eklem replasmanı ameliyatı olasılığını içeren bir tedavi planı tartışıldı.""")
Results
| | chunks | begin | end | entities |
|---:|:---------------------------------|--------:|------:|:-----------|
| 0 | sürekli ağrı | 58 | 69 | PROBLEM |
| 1 | şişlik | 72 | 77 | PROBLEM |
| 2 | hareket kısıtlılığı | 82 | 100 | PROBLEM |
| 3 | osteoartrit | 133 | 143 | PROBLEM |
| 4 | geçirilmiş diz yaralanması | 158 | 183 | PROBLEM |
| 5 | eklem aralığında daralma | 241 | 264 | PROBLEM |
| 6 | osteofit oluşumu | 267 | 282 | PROBLEM |
| 7 | kıkırdak dejenerasyonu bulguları | 287 | 318 | PROBLEM |
| 8 | bir MR taraması | 388 | 402 | TEST |
| 9 | MRG | 413 | 415 | TEST |
| 10 | ileri osteoartrit | 418 | 434 | PROBLEM |
| 11 | yoğun kıkırdak kaybı | 447 | 466 | PROBLEM |
| 12 | kemik değişiklikleri | 471 | 490 | PROBLEM |
| 13 | fizik tedavi | 567 | 578 | TREATMENT |
| 14 | eklem replasmanı ameliyatı | 583 | 608 | TREATMENT |
Model Information
| Model Name: | ner_clinical_pipeline |
| Type: | pipeline |
| Compatibility: | Healthcare NLP 5.0.2+ |
| License: | Licensed |
| Edition: | Official |
| Language: | tr |
| Size: | 1.2 GB |
Included Models
- DocumentAssembler
- SentenceDetectorDLModel
- TokenizerModel
- WordEmbeddingsModel
- MedicalNerModel
- NerConverterInternalModel