Description
This pretrained pipeline is built on the top of ner_clinical model.
Live Demo Open in Colab Copy S3 URI
How to use
from sparknlp.pretrained import PretrainedPipeline
ner_pipeline = PretrainedPipeline("ner_clinical_pipeline", "nl", "clinical/models")
result = ner_pipeline.annotate("""Een 50-jarige vrouw kwam naar de orthopedische polikliniek met klachten van aanhoudende pijn, zwelling en bewegingsbeperking in haar rechterknie. Ze meldde een voorgeschiedenis van artrose en eerder knieletsel. Klinisch onderzoek en röntgenfoto's toonden vernauwing van de gewrichtsruimte, osteofytvorming en kraakbeendegeneratie. Er werd een MRI-scan besteld om de diagnose te bevestigen en de ernst ervan te beoordelen. De MRI toonde uitgebreid kraakbeenverlies en botveranderingen die overeenkwamen met gevorderde artrose. Na afweging van de toestand en voorkeuren van de patiënt werd een behandelplan met fysiotherapie en de mogelijkheid van een gewrichtsvervangende operatie besproken.""")
import com.johnsnowlabs.nlp.pretrained.PretrainedPipeline
val ner_pipeline = PretrainedPipeline("ner_clinical_pipeline", "nl", "clinical/models")
val result = ner_pipeline.annotate("""Een 50-jarige vrouw kwam naar de orthopedische polikliniek met klachten van aanhoudende pijn, zwelling en bewegingsbeperking in haar rechterknie. Ze meldde een voorgeschiedenis van artrose en eerder knieletsel. Klinisch onderzoek en röntgenfoto's toonden vernauwing van de gewrichtsruimte, osteofytvorming en kraakbeendegeneratie. Er werd een MRI-scan besteld om de diagnose te bevestigen en de ernst ervan te beoordelen. De MRI toonde uitgebreid kraakbeenverlies en botveranderingen die overeenkwamen met gevorderde artrose. Na afweging van de toestand en voorkeuren van de patiënt werd een behandelplan met fysiotherapie en de mogelijkheid van een gewrichtsvervangende operatie besproken.""")
Results
| | chunks | begin | end | entities |
|---:|:---------------------------------------|--------:|------:|:-----------|
| 0 | aanhoudende pijn | 76 | 91 | PROBLEM |
| 1 | zwelling | 94 | 101 | PROBLEM |
| 2 | bewegingsbeperking in haar rechterknie | 106 | 143 | PROBLEM |
| 3 | artrose | 181 | 187 | PROBLEM |
| 4 | knieletsel | 199 | 208 | PROBLEM |
| 5 | Klinisch onderzoek | 211 | 228 | TEST |
| 6 | röntgenfoto's | 233 | 245 | TEST |
| 7 | vernauwing van de gewrichtsruimte | 255 | 287 | PROBLEM |
| 8 | osteofytvorming | 290 | 304 | PROBLEM |
| 9 | kraakbeendegeneratie | 309 | 328 | PROBLEM |
| 10 | een MRI-scan | 339 | 350 | TEST |
| 11 | De MRI | 422 | 427 | TEST |
| 12 | uitgebreid kraakbeenverlies | 436 | 462 | PROBLEM |
| 13 | botveranderingen | 467 | 482 | PROBLEM |
| 14 | gevorderde artrose | 506 | 523 | PROBLEM |
| 15 | een behandelplan | 588 | 603 | TREATMENT |
| 16 | fysiotherapie | 609 | 621 | TREATMENT |
| 17 | een gewrichtsvervangende operatie | 646 | 678 | TREATMENT |
Model Information
| Model Name: | ner_clinical_pipeline |
| Type: | pipeline |
| Compatibility: | Healthcare NLP 5.0.2+ |
| License: | Licensed |
| Edition: | Official |
| Language: | nl |
| Size: | 1.2 GB |
Included Models
- DocumentAssembler
- SentenceDetectorDLModel
- TokenizerModel
- WordEmbeddingsModel
- MedicalNerModel
- NerConverterInternalModel