Description
This pretrained pipeline is built on the top of ner_clinical model.
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How to use
from sparknlp.pretrained import PretrainedPipeline
ner_pipeline = PretrainedPipeline("ner_clinical_pipeline", "it", "clinical/models")
result = ner_pipeline.annotate("""Una donna di 50 anni si è presentata alla clinica ortopedica lamentando dolore persistente, gonfiore e limitata capacità di movimento del ginocchio destro. La paziente ha riferito un'anamnesi di osteoartrite e un precedente infortunio al ginocchio. Sono stati eseguiti un esame clinico e delle radiografie che hanno rivelato un restringimento dello spazio articolare, la formazione di osteofiti e segni di degenerazione della cartilagine. Per confermare la diagnosi e valutarne la gravità, è stata ordinata una risonanza magnetica. La risonanza magnetica ha mostrato un'estesa perdita di cartilagine e alterazioni ossee coerenti con un'osteoartrite avanzata. Dopo aver considerato le condizioni e le preferenze del paziente, è stato discusso un piano di trattamento che prevedeva il controllo del dolore, la fisioterapia e la possibilità di un intervento di sostituzione dell'articolazione.""")
import com.johnsnowlabs.nlp.pretrained.PretrainedPipeline
val ner_pipeline = PretrainedPipeline("ner_clinical_pipeline", "it", "clinical/models")
val result = ner_pipeline.annotate("""Una donna di 50 anni si è presentata alla clinica ortopedica lamentando dolore persistente, gonfiore e limitata capacità di movimento del ginocchio destro. La paziente ha riferito un'anamnesi di osteoartrite e un precedente infortunio al ginocchio. Sono stati eseguiti un esame clinico e delle radiografie che hanno rivelato un restringimento dello spazio articolare, la formazione di osteofiti e segni di degenerazione della cartilagine. Per confermare la diagnosi e valutarne la gravità, è stata ordinata una risonanza magnetica. La risonanza magnetica ha mostrato un'estesa perdita di cartilagine e alterazioni ossee coerenti con un'osteoartrite avanzata. Dopo aver considerato le condizioni e le preferenze del paziente, è stato discusso un piano di trattamento che prevedeva il controllo del dolore, la fisioterapia e la possibilità di un intervento di sostituzione dell'articolazione.""")
Results
| | chunks | begin | end | entities |
|---:|:----------------------------------------------------|--------:|------:|:-----------|
| 0 | dolore persistente | 72 | 89 | PROBLEM |
| 1 | gonfiore | 92 | 99 | PROBLEM |
| 2 | limitata capacità di movimento del ginocchio destro | 103 | 153 | PROBLEM |
| 3 | osteoartrite | 195 | 206 | PROBLEM |
| 4 | infortunio al ginocchio | 224 | 246 | PROBLEM |
| 5 | un esame clinico | 269 | 284 | TEST |
| 6 | delle radiografie | 288 | 304 | TEST |
| 7 | un restringimento dello spazio articolare | 325 | 365 | PROBLEM |
| 8 | formazione di osteofiti | 371 | 393 | PROBLEM |
| 9 | segni di degenerazione della cartilagine | 397 | 436 | PROBLEM |
| 10 | una risonanza magnetica | 507 | 529 | TEST |
| 11 | La risonanza magnetica | 532 | 553 | TEST |
| 12 | un'estesa perdita di cartilagine | 567 | 598 | PROBLEM |
| 13 | alterazioni ossee coerenti | 602 | 627 | PROBLEM |
| 14 | un'osteoartrite avanzata | 633 | 656 | PROBLEM |
| 15 | dolore | 797 | 802 | PROBLEM |
| 16 | fisioterapia | 808 | 819 | TREATMENT |
| 17 | un intervento di sostituzione dell'articolazione | 841 | 888 | TREATMENT |
Model Information
| Model Name: | ner_clinical_pipeline |
| Type: | pipeline |
| Compatibility: | Healthcare NLP 5.0.2+ |
| License: | Licensed |
| Edition: | Official |
| Language: | it |
| Size: | 1.2 GB |
Included Models
- DocumentAssembler
- SentenceDetectorDLModel
- TokenizerModel
- WordEmbeddingsModel
- MedicalNerModel
- NerConverterInternalModel