Pipeline to Detect Living Species(roberta_embeddings_BR_BERTo)

Description

This pretrained pipeline is built on the top of ner_living_species_roberta model.

Predicted Entities

Copy S3 URI

How to use

from sparknlp.pretrained import PretrainedPipeline

pipeline = PretrainedPipeline("ner_living_species_roberta_pipeline", "pt", "clinical/models")

text = '''Mulher de 23 anos, de Capinota, Cochabamba, Bolívia. Ela está no nosso país há quatro anos. Frequentou o departamento de emergência obstétrica onde foi encontrada grávida de 37 semanas, com um colo dilatado de 5 cm e membranas rompidas. O obstetra de emergência realizou um teste de estreptococos negativo e solicitou um hemograma, glucose, bioquímica básica, HBV, HCV e serologia da sífilis.'''

result = pipeline.fullAnnotate(text)
import com.johnsnowlabs.nlp.pretrained.PretrainedPipeline

val pipeline = new PretrainedPipeline("ner_living_species_roberta_pipeline", "pt", "clinical/models")

val text = "Mulher de 23 anos, de Capinota, Cochabamba, Bolívia. Ela está no nosso país há quatro anos. Frequentou o departamento de emergência obstétrica onde foi encontrada grávida de 37 semanas, com um colo dilatado de 5 cm e membranas rompidas. O obstetra de emergência realizou um teste de estreptococos negativo e solicitou um hemograma, glucose, bioquímica básica, HBV, HCV e serologia da sífilis."

val result = pipeline.fullAnnotate(text)

Results

|    | ner_chunks    |   begin |   end | ner_label   |   confidence |
|---:|:--------------|--------:|------:|:------------|-------------:|
|  0 | Mulher        |       0 |     5 | HUMAN       |       0.9975 |
|  1 | país          |      71 |    74 | HUMAN       |       0.8869 |
|  2 | grávida       |     163 |   169 | HUMAN       |       0.9702 |
|  3 | estreptococos |     283 |   295 | SPECIES     |       0.9211 |
|  4 | HBV           |     360 |   362 | SPECIES     |       0.9911 |
|  5 | HCV           |     365 |   367 | SPECIES     |       0.9858 |
|  6 | sífilis       |     384 |   390 | SPECIES     |       0.8898 |

Model Information

Model Name: ner_living_species_roberta_pipeline
Type: pipeline
Compatibility: Healthcare NLP 4.4.4+
License: Licensed
Edition: Official
Language: pt
Size: 654.1 MB

Included Models

  • DocumentAssembler
  • SentenceDetectorDLModel
  • TokenizerModel
  • RoBertaEmbeddings
  • MedicalNerModel
  • NerConverterInternalModel