Pipeline to Detect Clinical Conditions (ner_eu_clinical_condition - it)

Description

This pretrained pipeline is built on the top of ner_eu_clinical_condition model.

Predicted Entities

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How to use

from sparknlp.pretrained import PretrainedPipeline

pipeline = PretrainedPipeline("ner_eu_clinical_condition_pipeline", "it", "clinical/models")

text = "
Donna, 64 anni, ricovero per dolore epigastrico persistente, irradiato a barra e posteriormente, associato a dispesia e anoressia. Poche settimane dopo compaiono, però, iperemia, intenso edema vulvare ed una esione ulcerativa sul lato sinistro della parete rettale che la RM mostra essere una fistola transfinterica. Questi trattamenti determinano un miglioramento dell’ infiammazione ed una riduzione dell’ ulcera, ma i condilomi permangono inalterati.

"

result = pipeline.fullAnnotate(text)
import com.johnsnowlabs.nlp.pretrained.PretrainedPipeline

val pipeline = new PretrainedPipeline("ner_eu_clinical_condition_pipeline", "it", "clinical/models")

val text = "
Donna, 64 anni, ricovero per dolore epigastrico persistente, irradiato a barra e posteriormente, associato a dispesia e anoressia. Poche settimane dopo compaiono, però, iperemia, intenso edema vulvare ed una esione ulcerativa sul lato sinistro della parete rettale che la RM mostra essere una fistola transfinterica. Questi trattamenti determinano un miglioramento dell’ infiammazione ed una riduzione dell’ ulcera, ma i condilomi permangono inalterati.

"

val result = pipeline.fullAnnotate(text)

Results

|    | chunks                 |   begin |   end | entities           |   confidence |
|---:|:-----------------------|--------:|------:|:-------------------|-------------:|
|  0 | dolore epigastrico     |      30 |    47 | clinical_condition |      0.90845 |
|  1 | anoressia              |     121 |   129 | clinical_condition |      0.9998  |
|  2 | iperemia               |     170 |   177 | clinical_condition |      0.9999  |
|  3 | edema                  |     188 |   192 | clinical_condition |      1       |
|  4 | fistola transfinterica |     294 |   315 | clinical_condition |      0.97785 |
|  5 | infiammazione          |     372 |   384 | clinical_condition |      0.9996  |

Model Information

Model Name: ner_eu_clinical_condition_pipeline
Type: pipeline
Compatibility: Healthcare NLP 4.4.4+
License: Licensed
Edition: Official
Language: it
Size: 1.2 GB

Included Models

  • DocumentAssembler
  • SentenceDetectorDLModel
  • TokenizerModel
  • WordEmbeddingsModel
  • MedicalNerModel
  • NerConverterInternalModel