Description
This pretrained pipeline is built on the top of ner_living_species model.
How to use
from sparknlp.pretrained import PretrainedPipeline
pipeline = PretrainedPipeline("ner_living_species_pipeline", "gl", "clinical/models")
text = '''Muller de 45 anos, sen antecedentes médicos de interese, que foi remitida á consulta de dermatoloxía de urxencias por lesións faciales de tres semanas de evolución. A paciente non presentaba lesións noutras localizaciones nin outra clínica de interese. No seu centro de saúde prescribíronlle corticoides tópicos ante a sospeita de picaduras de artrópodos e unha semana despois, antivirales orais baixo o diagnóstico de posible infección herpética. As lesións interferían de forma notable na súa vida persoal e profesional xa que traballaba de face ao púbico. Unha semana máis tarde o diagnóstico foi confirmado ao resultar o cultivo positivo a Staphylococcus aureus.'''
result = pipeline.fullAnnotate(text)
import com.johnsnowlabs.nlp.pretrained.PretrainedPipeline
val pipeline = new PretrainedPipeline("ner_living_species_pipeline", "gl", "clinical/models")
val text = "Muller de 45 anos, sen antecedentes médicos de interese, que foi remitida á consulta de dermatoloxía de urxencias por lesións faciales de tres semanas de evolución. A paciente non presentaba lesións noutras localizaciones nin outra clínica de interese. No seu centro de saúde prescribíronlle corticoides tópicos ante a sospeita de picaduras de artrópodos e unha semana despois, antivirales orais baixo o diagnóstico de posible infección herpética. As lesións interferían de forma notable na súa vida persoal e profesional xa que traballaba de face ao púbico. Unha semana máis tarde o diagnóstico foi confirmado ao resultar o cultivo positivo a Staphylococcus aureus."
val result = pipeline.fullAnnotate(text)
Results
| | ner_chunks | begin | end | ner_label | confidence |
|---:|:----------------------|--------:|------:|:------------|-------------:|
| 0 | Muller | 0 | 5 | HUMAN | 0.9998 |
| 1 | paciente | 167 | 174 | HUMAN | 0.9985 |
| 2 | artrópodos | 344 | 353 | SPECIES | 0.9647 |
| 3 | antivirales | 378 | 388 | SPECIES | 0.8854 |
| 4 | herpética | 437 | 445 | SPECIES | 0.9592 |
| 5 | púbico | 551 | 556 | HUMAN | 0.7293 |
| 6 | Staphylococcus aureus | 644 | 664 | SPECIES | 0.87005 |
Model Information
| Model Name: | ner_living_species_pipeline |
| Type: | pipeline |
| Compatibility: | Healthcare NLP 4.3.0+ |
| License: | Licensed |
| Edition: | Official |
| Language: | gl |
| Size: | 794.9 MB |
Included Models
- DocumentAssembler
- SentenceDetectorDLModel
- TokenizerModel
- WordEmbeddingsModel
- MedicalNerModel
- NerConverterInternalModel